s3のレプリケーションは機能有効化した後のデータしかレプリケートしない
Amazon S3 は何をレプリケートしますか - Amazon Simple Storage Service
デフォルトでは、Amazon S3 は以下をレプリケートします。 レプリケーション設定の追加後に作成されたオブジェクト。
既存のオブジェクトのレプリケーション
というメニューもあるようだが、サポート依頼なので あくまでオプション的な機能のようだ。
S3 バッチオペレーション の実行 - Amazon Simple Storage Service
aws cli使うかbatch operationを使う感じで。 いずれにせよ設定しただけでどうにかなるものではないみたい。